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北京市昌平卫生学校始建于1973年。1986年经北京市政府批准、投资，单独建立校址，正式成为北京市中等专业学校之一，办学规模为640人。昌平卫校经过不断地发展扩大，现已成为集普通中专、成人大、中专教育和昌平区在职医务人员继续教育基地为一体的中等职业学校。 根据北京市政府2005年制定的中大力发职业教育、建设社会主义新农村、把发展社区及农村医疗卫生工作作为今后发展的重点的指示精神，昌平卫校自2006年以来，彻底整顿校园秩序，提升现代化管理的能力，整治校园环境，完善基础设施建设，借以适应新时期的要求。
昌平卫校行政隶属于北京市昌平区卫生局，为全额拨款事业单位。占地面积40.14亩，建筑面积1.7万㎡。学校拥有五层教学办公楼1栋，五层学生宿舍楼两栋，三层教学宿舍综合楼1栋及附助设施。学校现有教学实验室14个，多媒体教室29个。2005年9月，为配合实践性教学，学校将原附属医院改为校内实训基地，建筑面积1500㎡。
根据北京市政府2005年制定的《北京市2005-2010五年发展规划》中大力发职业教育、建设社会主义新农村、把发展社区及农村医疗卫生工作作为今后发展的重点的指示精神，昌平卫校作为北京市仅被保留的五所中专卫护校之一，任务光荣而艰巨。昌平卫校自2006年以来，在新任校长邓书林同志的带领下，相继进行了领导班子的调整、人事制度改革，彻底整顿校园秩序，提升现代化管理的能力，整治校园环境，完善基础设施建设，借以适应新时期的要求。
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